Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3Q9H299 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BGRL3Q9H299 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3Q9H299 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SH3BGRL3Q9H299 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SH3BGRL3Q9H299 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SH3BGRL3Q9H299 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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