Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LNPKQ9C0E8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LNPKQ9C0E8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms