Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP4Q9C0A0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms