Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCGF6Q9BYE7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCGF6Q9BYE7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms