Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms