Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP1Q9BWH6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms