Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THUMPD2Q9BTF0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms