Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTA3Q9BTC8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms