Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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