Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TIMM29Q9BSF4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms