Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FYCO1Q9BQS8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FYCO1Q9BQS8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms