Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC5LQ99459 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms