Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2Q96Q42 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALS2Q96Q42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms