Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBP4Q96PP9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms