Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YTHDC1Q96MU7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YTHDC1Q96MU7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms