Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM20AQ96MK3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM20AQ96MK3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms