Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX22Q96L94 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms