Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PRAC1Q96KF2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms