Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC34Q96HJ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms