Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC41A3Q96GZ6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms