Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RNFT2Q96EX2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RNFT2Q96EX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms