Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms