Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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