Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAVIN3Q969G5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms