Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAMP4Q969E2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms