Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUFY2Q8WXA3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms