Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC191Q8NCU4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC191Q8NCU4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms