Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PNLDC1Q8NA58 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms