Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMTC2Q8N394 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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