Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf40Q8IXQ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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C9orf40Q8IXQ3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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C9orf40Q8IXQ3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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C9orf40Q8IXQ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf40Q8IXQ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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