Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME9Q86XW9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms