Protein–RNA interactions for Protein: Q86WU2

LDHD, Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHDQ86WU2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LDHDQ86WU2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LDHDQ86WU2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms