Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMC1Q7Z7K0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMC1Q7Z7K0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms