Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
UBE2Q1Q7Z7E8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE2Q1Q7Z7E8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms