Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms