Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD6Q6ZV73 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms