Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FAM43BQ6ZT52 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms