Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00575Q6W349 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00575Q6W349 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms