Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC171Q6TFL3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC171Q6TFL3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms