Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSSK4Q6SA08 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSSK4Q6SA08 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms