Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
CSAG1Q6PB30 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms