Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RCSD1Q6JBY9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms