Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CARMIL2Q6F5E8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms