Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms