Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HES3Q5TGS1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HES3Q5TGS1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms