Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms