Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GREB1Q4ZG55 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GREB1Q4ZG55 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms