Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRRC36Q1X8D7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms