Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHPRHQ149N8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHPRHQ149N8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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