Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SSPNQ14714 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSPNQ14714 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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